一、来源不同：
化橘红：即化州橘红，来源本品为芸香科植物化州柚或柚的未成熟或近成熟的干燥外层果皮。前者习称“毛橘红”，后者习称“光七爪”“光五爪”。橘红：则为芸香科植物橘CitrusreticulataBlanco及其栽培变种的干燥外层果皮。秋末冬初果实成熟后采收，用刀削下外果皮，晒干或阴干。
国家药典明确将“橘红”与“化橘红”分别列出。从《中药调剂规程》上也可以看出，正名有“橘红”和“化橘红”两种，其中处方写“化橘红”、“七爪红”时，应付给“化橘红”；写“橘红”、“广橘红”时，应付给“橘红”。橘红、化橘红均为芸香科植物,但同科不同种。
二、性状和有效成份不同
橘红：呈不规则长条或不整齐薄片状，表面*棕或橙红色，有光泽，密布油点，气芳香，味微苦而后觉麻舌。主要有效成份含橙皮苷。
化橘红：多呈对折的七角、六角或五角星形，外皮*或*绿色，密布毛茸，有皱纹及小凹点，一般化州柚多加工成七角，习称“七爪红”；柚多加工成五角或六角，“五角”习称“大五爪”，“六角”习称“六爪红”，气微香，味苦。主要含柚皮苷。
三、功能主治不同
两者味皆苦、辛，性温。归肺、脾二经。但橘红理气宽中，燥湿化痰，用于咳嗽痰多及食积不化等症而无热象者；化橘红化痰理气，健脾消食，用于胸中痰滞，咳嗽气喘，饮食积滞，呕吐呃逆等症。在使用上应注意：橘红在人体阴虚燥咳及久咳气虚时不宜服用；化橘红在人体气虚及阴虚有燥痰者不宜服用。
在中成药的应用时，桔红丸、止咳橘红口服液、止咳定喘丸等中成药中常配伍化橘红，而在桔红化痰丸、橘贝半夏、橘红痰咳冲剂(口服液)等中成药中常配伍橘红。
四、临床应用不同
1、小儿反复呼吸道感染：化橘红与*芪、茯苓、*精、鸡内金、青黛等配伍。2、百日咳：橘红与大青叶、龙胆草、栀子、藕节等配伍治疗；3、癫痫：在抗癫散与刘氏定痫汤中配伍它药治疗；4、脑血栓：在导痰通络汤中与清半夏、泽泻、菖蒲、枳实、红花等配伍治疗脑血栓；5、膝关节滑膜炎：与白术、生地、赤芍、归尾等配伍组成橘术四物汤加外敷治疗膝关节滑膜炎；6、霰粒肿：与半夏、海藻等配伍治疗霰粒肿。
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